Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms