Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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