Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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