Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms