Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NRF1Q16656 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms