Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FXNQ16595 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms