Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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