Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms