Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms