Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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