Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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