Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms