Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms