Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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