Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PTCH1Q13635 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PTCH1Q13635 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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