Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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