Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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