Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
STRN3Q13033 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.7 ms