Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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