Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms