Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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