Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms