Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR1184-2-201ENST00000408263 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR1184-1-201ENST00000408606 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR1184-3-201ENST00000408676 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AKR1C3-202ENST00000439082 972 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL7P-201ENST00000467823 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC137055.1-201ENST00000549333 395 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR3972-201ENST00000582732 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SSX3-204ENST00000612497 1030 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 KRTAP22-1-201ENST00000334680 296 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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