Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRRQ15256 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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