Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL4A6Q14031 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms