Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SNTA1Q13424 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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SNTA1Q13424 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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SNTA1Q13424 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SNTA1Q13424 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SNTA1Q13424 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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