Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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