Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKHD1P08F94 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKHD1P08F94 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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