Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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