Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms