Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms