Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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