Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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