Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SS18Q15532 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms