Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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