Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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