Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms