Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXO1Q12778 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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