Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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