Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RTL8BQ17RB0 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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