Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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HERC1Q15751 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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