Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms