Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
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