Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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