Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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