Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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