Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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