Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPN13Q12923 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPN13Q12923 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPN13Q12923 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPN13Q12923 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPN13Q12923 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPN13Q12923 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPN13Q12923 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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