Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXO1Q12778 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXO1Q12778 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXO1Q12778 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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