Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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